根据通过现场勘察和结合水库修建情况、运行情况进行综合分析，查准渗漏成因和类型，对水库不同类型的渗漏进行不同的整治方案。由于大坝筑坝材料不满足规范要求和大坝施工质量差造成的渗漏可通过钻孔对大坝坝体进行勘察，室内土工试验查明坝体填筑土料的物理力学性质，同时对坝基基岩进行压水试验，查明基岩渗漏带范围，根据基岩渗漏带厚度采取帷幕灌浆、土坝灌浆或土工膜防渗的方式进行整治。比如我县龙会水库，由于水库修建于石灰岩地区，修建时未进行地质勘察，筑坝时施工质量差，水库建成后发现水库左坝肩基岩渗漏、同时水库外坝反滤层上部呈带状渗水。通过地质勘察，发现水库基岩强透水带厚8—12m，同时坝体渗透系数大，因此水库整治方案采用基岩帷幕灌浆结合土坝灌浆方式进行整治。2008 年由四川省水利科学研究院进行整治设计，采用单排布孔，帷幕灌浆孔距1.5m，采用水泥浆灌注，土坝灌浆孔距3m，采用土水泥浆灌注，水泥掺量5%。工程完成后达正常水位，坝后和左坝肩渗漏现象消失，达到整治目的。
由于大坝白蚁危害造成的大坝渗漏，可以通过巡查、布置诱杀坑和埋设药包等方式进行白蚁灭杀，比如2002 年红旗水库除险加固工程对水库大坝内外坝坡都采用了预制混领土板护坡，加上布置诱杀坑和埋设药包等方式进行白蚁灭杀，从而该水库白蚁危害得到控制。
